但保险公司只赔偿了医药费的80%，我该如何处理

对方全责时保险公司未全赔，剩余20%应由肇事方承担。依据《道路交通安全法》，事故损失应由责任方负责，保险公司未全额赔偿时，肇事方需承担剩余部分。不及时处理可能导致权益受损，影响赔偿款的追回。
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对方全责未全赔，可这样处理：1.与肇事方、保险公司协商，明确赔偿责任；2.若协商无果，申请交警部门调解，达成赔偿协议；3.调解不成，准备证据起诉至法院，要求支付全部赔偿。
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处理此问题可协商、调解或诉讼。首先尝试与肇事方及保险公司协商，协商不成可申请交警调解，若调解无果，则向法院提起诉讼，根据事故责任和损失情况选择最佳方式。